Может, что-то пропущено из работающих серий или cлучайно включены уже закрытые, но тем не менее, видна тенденция издательств.

С 2009 (в этом году открыты "сольные" и зарубежные проекты):

Азбука
"Юмористическое фэнтези" - Тематическая серия, в которой планируются к изданию книги Крега Шоу Гарднера.

Олма Медиа Групп
«Сварог. Избранное» - Бушков о Станиславе Свароге.

Астрель, АСТ
«Нил Гейман» - сабж

Эксмо
«Мастера меча и магии» - переводные
«Русская альтернатива» - Серия книг, написанных в жанре альтернативной истории. (пока только В. Звягинцев)
"Сумерки" - вампирско-девочковая фантастика. На данный момент в серии выходят книги только Скотта Вестерфельда.
«Без маски» - Персональная серия Дмитрия Громова и Олега Ладыженского (Г.Л. Олди)


2008 :

Азбука, Азбука-классика
«FANOTEKA» - Серия антологий, отделившаяся от основной серии «Лучшее». В ней публикуются тематические антологии отечественных авторов.

Хранитель, Харвест, АСТ
«с/с Юлии Остапенко»
Астрель, АСТ
«с/с Дж. Р. Р. Толкина (цв.)»
«Мост птиц» (М., Аст; СПб., Астрель, Arabesque-Books) Зарубежные авторы. Все книги этой серии — о Китае вымышленном и реальном.
"Язычники" - историческое фэнтези отечественных авторов.

Лениградское изд-во
"Городские легенды" - фэнтези романы современных отечественных авторов. (А. Прозоров, Я. Коваль)

Эксмо
«TimeZero» - издают научную фантастику современных отечественных авторов. «TimeZero» — это онлайновая компьютерная игра.

Эксмо, Домино
«Мировой фантастический боевик» - зарубежные
"Эпоха доблести" - Серия романтического фэнтези, в основном, с дамским взглядом на жизнь. Формироваться будет главным образом из соответствующих произведений авторов-женщин. В ней, в частности, планируется переиздание всех книг Элеоноры Раткевич.
«Черная Fantasy» - кроме трилогии Джо Абекромби, обещано переиздание трилогии «Князь пустоты» Скотта Бэккера, а также издание «Малазанской книги павших» Стивена Эриксона.
«Матрица. Киберреальность» - серия на данный момент представляет собой собрания сочинений (пока далеко не полные) Иэна М. Бэнкса и Брюса Стерлинга. Временно новых книг нет.
«Война в космосе» - на данный момент в ней выходят книги Дэвида Вебера
«Гостья из будущего» - Авторская серия Кира Булычева
«Вадим Панов» - сабж
«Большая серия русской фантастики» - планируется выпускать циклы мэтров и мэтресс

Эксмо, Яуза
«Военно-историческая фантастика» В ней издается фантастика такого жанра, как альтернативная история с военно-патриотическим уклоном современных русскоязычных авторов.

2007:

Азбука-классика, Фантастика

"Лучшее" - Серия тематических антологий, в ней издаются переводные и российские антологии, посвященные различным направлениям современной фантастики.

Аст, Северо-Запад-пресс
"Историческое фэнтези" - Прозоров, Иволгина (Хаецкая)
"Ведунья" - Денис Чекалов
"Бригадир державы" - цикл исторического фэнтези Сергея Шхияна.

Домино, Эксмо
«Book Revolution» - только зарубежные "неформатные" авторы.
«Роман-мистерия Жозе Сарамаго» - сабж
«Звезды фантастики» - зарубежные
«Русский фантастический боевик»
«Звездный десант» - боевая космическая фантастика русскоязычных авторов
"Герои неизведанных миров" (Илья Новак)
S.T.A.L.K.E.R. - посвящена миру компьютерной игры «S.T.A.L.K.E.R.» Русскоязычные авторы.

2006:

Азбука-классика

«Ultima» - только зарубежная альтернативная история
«Реальность под контролем» а/с - Новак Илья

АСТ и др.
«с/с Нила Геймана»
«Монохром» - зарубежные авторы

Крылов

"МК fantasy" - циклы исторического фэнтези отечественных современных авторов (Дворецкая, Гореликова, Казаков, Русанов).
"Мужской клуб" - фэнтези отечественных авторов: омнибусы, содержащие произведения одного цикла или очень большие по объему романы.

Ленинградское издательство
"Дракон" - Название условное, по изображению эмблемы и логотипа серии. В ней издают фэнтези современных отечественных авторов.

Домино, Эксмо

«Звезды фантастики» - только зарубежные
"Короли фэнтези" - зарубежные
«Боевая магия» - произведения русскоязычных авторов
«Похитители миров» - а/с тандема Новак Илья, Жаков Лев


Хранитель, Харвест, Астрель-СПб, АСТ Москва, АСТ

«Кинг-Юниор» - только переводная подростковая фантастика о вампирах и оборотнях (н-р Майер).

«Science Fiction» - только зарубежная фантастика


с 2005 -

Форум
«Другая сторона» - Единственная серия фантастики издательства «Форум». Публикуются книги всех направлений — от киберпанка и космооперы до фэнтези и альтернативной истории. Преиущественно это неформатные книги молодых авторов, которые не вписываются в серии других издательств.
В 2008-м вышло по данным сайта ФантЛаб в серии вышло две книги, за 2009-й мной не найдены (или не обновлялась информация?)

Ленинградское издательство
"Боевая фантастика" - издают осросюжетную научную фантастику современных русскоязычных авторов.

Хранитель, АСТ
«Фантастика настоящего и будущего» - Серия издательств «АСТ» и «Астрель-СПб», в которой печатают произведения молодых российских авторов, часто дебютные.

Ленинградское изд-во
"Боевая фэнтези"

Эксмо, Домино
«Люди против магов» - Большая часть авторов переводная, из российских были переизданы только Марина и Сергей Дяченко со своей трилогией «Маг дороги».
«Книга-загадка, книга-бестселлер» - только переводная фантастика

с 2004 -

Армада, АРМАДА: «Издательство Альфа-книга», «Издательство АЛЬФА-КНИГА»
«Магия фэнтези» - романы (и очень редко сборники повестей и рассказов) современных отечественных писателей. Кроме собственно жанра фэнтези ограничений на произведения практически нет. В серии можно встретить, как «героику», так и фэнтези с философским уклоном, бывает и мистическое фэнтези, и ироническое и классические «квесты». Попадается даже такой редкий зверь, как «производственное фэнтези».

Хранитель, Азбука, Транзиткнига, Харвест, Астрель, Астрель-СПб, АСТ Москва, АСТ
«под Дозоры» - В серии издаются омнибусы циклов, как российских, так и зарубежных авторов, собрания сочинений, а также (иногда) нестандартные романы, которые не очень подходят для других серий. (неизвестных имен не замечено :)

Эксмо
«Ник Перумов»

с 2003 -

Домино, Terra Fantastica, Эксмо
«Отцы-Основатели. Отцы-Основатели (+ Легенды фантастики)»
"Русская фантастика"

с 2001 -

Домино, Яуза, Terra Fantastica, Эксмо-пресс, Валери СПД, Эксмо
«Шедевры фантастики» - выходят лучшие произведения в основном зарубежной фантастики и фэнтези (исключение пока составляет трилогия «Кольцо тьмы» Ника Перумова).

С 2000

Армада (Альфа-книга)
"Юмористическая фантастика" - это наше всё)

с 1998

Домино, Валери СПД, Эксмо-Пресс, Эксмо
«Фэнтези Ника Перумова (мрамор)» - Кроме (само собой:) Ника Перумова в серии изданы С. Логвинов, В. Камша, А. Дихнов (и еще у четырех авторов по книжке)

Аст и др.
"Звездный лабиринт" - русскоязычная фантастика
"Заклятые миры" - русскоязычная фэнтези (ходят слухи, что серию закрывают)

с 1996

Эксмо
"Абсолютное оружие" - фантастика отечественных авторов, работающих как в жанре НФ, так и в других.


С 1992

Армада (Альфа-книга)
"Фантастический боевик" - предпочтение отдается русскоязычной фантастике